Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc5a3Q9JKZ2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms