Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hip1rQ9JKY5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hip1rQ9JKY5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hip1rQ9JKY5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hip1rQ9JKY5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hip1rQ9JKY5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hip1rQ9JKY5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hip1rQ9JKY5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hip1rQ9JKY5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hip1rQ9JKY5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hip1rQ9JKY5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hip1rQ9JKY5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hip1rQ9JKY5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hip1rQ9JKY5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hip1rQ9JKY5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms