Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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