Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms