Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gfra4Q9JJT2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gfra4Q9JJT2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms