Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms