Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms