Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS6

Vmn1r171, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r171Q9EPS6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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