Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms