Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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