Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms