Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg8Q9DBM0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms