Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpraQ9DBG7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms