Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtr1Q9DBC3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtr1Q9DBC3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms