Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms