Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms