Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Tmem239Q9DA47 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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