Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms