Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms