Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms