Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Snx5Q9D8U8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Snx5Q9D8U8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms