Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms