Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp2c55Q9D816 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms