Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7H3

RtcA, RNA 3'-terminal phosphate cyclase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcAQ9D7H3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RtcAQ9D7H3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RtcAQ9D7H3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms