Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms