Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rab11fip1Q9D620 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rab11fip1Q9D620 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rab11fip1Q9D620 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rab11fip1Q9D620 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rab11fip1Q9D620 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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