Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PudpQ9D5U5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PudpQ9D5U5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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