Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam227bQ9D518 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms