Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms