Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms