Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Pabpc6Q9D4E6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Pabpc6Q9D4E6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Pabpc6Q9D4E6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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Pabpc6Q9D4E6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Pabpc6Q9D4E6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Pabpc6Q9D4E6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Pabpc6Q9D4E6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Pabpc6Q9D4E6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Pabpc6Q9D4E6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Pabpc6Q9D4E6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Pabpc6Q9D4E6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc6Q9D4E6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pabpc6Q9D4E6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pabpc6Q9D4E6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pabpc6Q9D4E6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pabpc6Q9D4E6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Pabpc6Q9D4E6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Pabpc6Q9D4E6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc6Q9D4E6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc6Q9D4E6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc6Q9D4E6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc6Q9D4E6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc6Q9D4E6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc6Q9D4E6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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