Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms