Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms