Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag1Q9D3E6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag1Q9D3E6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag1Q9D3E6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag1Q9D3E6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag1Q9D3E6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag1Q9D3E6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Stag1Q9D3E6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stag1Q9D3E6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms