Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms