Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Krt20Q9D312 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Krt20Q9D312 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Krt20Q9D312 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Krt20Q9D312 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Krt20Q9D312 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms