Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms