Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms