Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd3Q9D176 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms