Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc3Q9D114 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms