Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed3Q9D0L1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms