Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc18Q9CZJ9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms