Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc77Q9CZH8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms