Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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