Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms