Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrs1Q9CYH6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrs1Q9CYH6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrs1Q9CYH6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrs1Q9CYH6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrs1Q9CYH6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrs1Q9CYH6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms