Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sgo1Q9CXH7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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