Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmed5Q9CXE7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmed5Q9CXE7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmed5Q9CXE7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmed5Q9CXE7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed5Q9CXE7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tmed5Q9CXE7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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