Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms