Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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